61. Hükümet’in sona ermesiyle birlikte Bakan Yardımcıları’nın görevlerinin sona erdiği biliniyordu. Recep Akdağ döneminde Bakan Yardımcısı olarak atanan Agah Kafkas, mevcut Bakan Müezzinoğlu ile bir buçuk yıla yakın görev yaptı. MÜEZZİNOĞLU TEBLİĞ ETTİ! Agah Kafkas’ın görev süresinin yenilenmeyeceği Bakan Müezzinoğlu tarafından kendisine bildirildi. Akdağ döneminden devam eden üst düzey bürokratlarla yolların ayrılmasının ardından, son siyasi bürokrat olan Kafkas da görevinden ayrılmış oldu. Agah Kafkas’ın bakanlıktan ayrılışı esnasında hoş olmayan bazı olayların yaşandığı da gelen bilgiler arasında.
Bilindiği üzere 18 Temmuz 2009 tarihinde yapılan Ak Parti Çankırı 3. Olağan İl Kongresinde Çorum Milletvekili olarak konuşma yapan divan başkanı Kafkas, yaptığı konuşma sonrasında “bu söylediklerimi Çankırı anlarsa tüm Türkiye anlar” diyerek Çankırılıları anlaması kıt insanlar konumuna sokarak büyük bir pot kırmıştı.
